Словарь русских фамилий - каликин

Основа фамилии слово калика , самое известное его значение странствующий нищий, певец. Но это вторичное значение. Кое-где калика спутался с калекой, и используется в значении убогий, увечный. А еще калики на Валдае башмаки, черевички, обутки или саедали, поршни, обувь странников.

От какого значение произошло прозвище и затем фамилия может узнать только сам носитель этой амилии исследуя историю своей семьи.

И з дбавлений посетителй сайта.

По моим сведениям в этимологию этой фамилии можно добавить то, что в некоторых местностях России (не знаю точно каких) "каликой" называют ягоду иргу. Но это так, для придания фамилии цветочного аромата :).